Investigation d'une épidémie et traçage des contacts

Microbiologie & immunologie · Master 2

Investigation de foyer, courbe épidémique, mesures d'association et traçage des contacts.

Introduction

L'investigation d'une épidémie est une démarche structurée visant à identifier la source et le mode de transmission d'un foyer afin de proposer rapidement des mesures de contrôle. Les épidémiologistes de terrain suivent une série d'étapes, de la confirmation de l'existence du foyer à la communication des résultats.

La courbe épidémique, graphique des cas par date de début des symptômes, renseigne sur le type de source (ponctuelle, continue, propagée). Les études cas-témoins ou de cohorte testent les hypothèses d'exposition, avec odds ratio ou risque relatif. Le traçage des contacts identifie, informe et suit les personnes exposées pour interrompre les chaînes de transmission.

Le séquençage génomique complète ces outils en reliant les isolats et en confirmant ou en excluant l'appartenance à un même foyer.

Objectifs d'apprentissage

Énumérer les étapes d'une investigation de foyer
Définir un cas et construire une courbe épidémique
Choisir entre étude cas-témoins et de cohorte
Décrire les principes du traçage des contacts

Concepts clés

Étapes d'investigation: Confirmer l'existence du foyer, vérifier le diagnostic, définir les cas, chercher les cas, décrire par temps-lieu-personne, formuler et tester des hypothèses, mettre en œuvre le contrôle et communiquer.
Courbe épidémique: Source ponctuelle : pic unique en un intervalle correspondant à l'incubation. Source continue : plateau prolongé. Propagée : pics successifs espacés d'une période d'incubation.
Cas-témoins et cohorte: Cas-témoins : compare l'exposition de malades et non-malades, mesure par odds ratio. Cohorte : suit des exposés et non-exposés, mesure par risque relatif, adaptée à un groupe défini comme un banquet.

Conclusion

L'investigation de foyer allie rigueur méthodologique et rapidité : confirmer, décrire, formuler des hypothèses, tester et agir, sans attendre la certitude absolue lorsque la santé publique est en jeu.

Les outils classiques, courbe épidémique et études analytiques, sont aujourd'hui renforcés par le séquençage génomique et des systèmes de traçage numériques, au service de la décision rapide des autorités sanitaires cantonales et fédérales.

Cartes

Première étape d'une investigation ?: Confirmer l'existence d'un foyer, en comparant le nombre de cas à l'attendu, et vérifier le diagnostic.
Qu'est-ce qu'une définition de cas ?: Ensemble de critères cliniques, biologiques, de temps, lieu et personne déterminant si un individu est inclus dans le foyer.
Que permet la courbe épidémique ?: Identifier le type de source et de propagation, estimer la période d'exposition grâce à l'incubation.
Qu'est-ce qu'une source ponctuelle ?: Exposition simultanée d'un groupe à une même source, donnant un pic unique.
Taux d'attaque ?: Nombre de malades divisé par nombre d'exposés.
Quand utiliser une étude de cohorte ?: Lorsque la population exposée est bien définie (banquet, école) et qu'on peut calculer un risque relatif.
Qu'est-ce qu'un odds ratio ?: Rapport des cotes d'exposition entre cas et témoins, approximant le risque relatif pour une maladie rare.
Principe du traçage des contacts ?: Identifier, informer et suivre les personnes exposées à un cas pour détecter précocement de nouveaux cas.
Que fait le séquençage génomique dans un foyer ?: Montrer que les isolats sont génétiquement proches, confirmer un lien ou exclure des cas non liés.

Glossaire

Foyer épidémique: Survenue de cas supérieure à l'attendu avec un lien commun.
Définition de cas: Critères standardisés d'inclusion d'un cas.
Courbe épidémique: Histogramme des cas par date de début.
Taux d'attaque: Proportion de malades parmi les exposés.
Odds ratio: Mesure d'association des études cas-témoins.
Traçage des contacts: Identification et suivi des personnes exposées.