# Dysbiose, infection à Clostridioides difficile et transplantation fécale

Microbiologie & immunologie · Master 1

> Dysbiose post-antibiotique, physiopathologie de C. difficile et transplantation de microbiote fécal.

## Introduction

La dysbiose désigne une altération de la composition ou de la fonction du microbiote associée à une maladie : perte de diversité, de producteurs de butyrate et pullulation de Pseudomonadota. Elle est favorisée par les antibiotiques, l'alimentation et l'inflammation.

Clostridioides difficile en est le paradigme : bacille anaérobie sporulé, il profite de la perte de résistance à la colonisation et de l'accumulation d'acides biliaires primaires qui induisent la germination des spores. Ses toxines TcdA et TcdB glucosylent les Rho-GTPases, provoquant diarrhée, colite pseudomembraneuse et parfois mégacôlon toxique. Les récidives touchent environ 20 à 25 % des patients après un premier épisode.

La transplantation de microbiote fécal (TMF), ainsi que des consortia définis approuvés (par exemple des produits à base de spores ou de microbiote rectal), restaurent la résistance à la colonisation avec des taux de guérison supérieurs à 80 % dans les récidives. En Suisse, la TMF est pratiquée dans des centres hospitaliers universitaires, avec banques de selles encadrées.

## Objectifs d'apprentissage

- Définir la dysbiose et ses limites conceptuelles
- Décrire la physiopathologie de l'infection à C. difficile
- Expliquer le rôle des acides biliaires dans la germination des spores
- Comparer vancomycine, fidaxomicine, bezlotoxumab et TMF
- Décrire les critères de sélection des donneurs de TMF

## Concepts clés

- **Dysbiose** : Changement de composition ou de fonction du microbiote lié à un état pathologique ; relation causale à démontrer.
- **Toxines TcdA/TcdB** : Glucosyltransférases inactivant les Rho-GTPases, cause de la rupture du cytosquelette et de l'inflammation colique.
- **Germination des spores** : Déclenchée par les acides biliaires primaires (taurocholate) en l'absence de 7α-déshydroxylation par les commensaux.
- **TMF** : Transfert de microbiote d'un donneur sain pour restaurer l'écosystème ; très efficace dans les infections récidivantes.

## Conclusion

La dysbiose est à la fois cause et conséquence de nombreuses pathologies, mais l'infection à C. difficile en offre le modèle le plus abouti, avec une réponse thérapeutique directement fondée sur la restauration de l'écosystème.

La TMF a ouvert la voie aux thérapies basées sur des consortia définis, plus standardisées et sûres.

## Cartes

### Quelle bactérie cause la colite pseudomembraneuse post-antibiotique ?

Clostridioides difficile, bacille à Gram positif anaérobie sporulé.

### Quelles toxines produit C. difficile ?

TcdA (entérotoxine) et TcdB (cytotoxine), parfois la toxine binaire CDT.

### Quel est leur mécanisme ?

Glucosylation de Rho, Rac et Cdc42, entraînant l'arrondissement cellulaire.

### Quels antibiotiques favorisent le plus la maladie ?

Clindamycine, céphalosporines, fluoroquinolones, amoxicilline-clavulanate.

### Pourquoi les spores résistent-elles au gel hydroalcoolique ?

Elles ne sont pas inactivées par l'alcool ; il faut lavage à l'eau et au savon et désinfection sporicide.

### Quel traitement de première ligne selon les recommandations actuelles ?

La fidaxomicine ou la vancomycine orale ; le métronidazole n'est plus recommandé en première ligne.

### Que cible le bezlotoxumab ?

Un anticorps monoclonal neutralisant la toxine B, réduisant les récidives.

### Quel est le principe de la TMF ?

Restaurer la diversité et la résistance à la colonisation par transfert de microbiote de donneur dépisté.

### Que dépiste-t-on chez les donneurs de TMF ?

Pathogènes, bactéries multirésistantes, virus (VIH, hépatites), parasites et critères cliniques ; exclusion en cas de risque.

## Glossaire

- **Dysbiose** : Déséquilibre du microbiote associé à une maladie.
- **Spore** : Forme de résistance dormante de certaines bactéries à Gram positif.
- **Colite pseudomembraneuse** : Inflammation colique avec pseudomembranes fibrino-leucocytaires.
- **Récidive** : Réapparition de la maladie dans les 8 semaines suivant un traitement efficace.
- **Consortium défini** : Mélange standardisé de souches ou spores utilisé comme alternative à la TMF.
- **Acides biliaires secondaires** : Produits de la 7α-déshydroxylation microbienne qui inhibent la germination de C. difficile.

https://ruvy.ch/decks/-P5CSVdklUy-lWseLG6b
